Хеппи энды хорошо в таких случаях как БСГ, Вояджер ибо там есть цель которая долго долго достигается, и в конце концов сидишь и ждешь когда же цель будет достигнута и каким образом все это обставят. А вот в Атлантисе нету единой цели, поэтому там можно делать конец какой угодно, например потопить Атлантис.